2013年2月开始，我国长三角地区暴发了由新型H7N9禽流感病毒引发的严重疫情。湖州市位于浙江省北部，地处长三角腹地，与江苏、安徽省接壤，紧邻上海，是H7N9疫情的重灾区之一。应湖州市疾病预防控制中心的邀请，上海巴斯德所副所长蓝柯带领由研究员冷启彬、周东明、张驰宇以及王莉莉、刘嘉等技术人员组成的研究团队，赴该地合作研究。
通过对湖州2013年4月采集的禽类样品（粪便、污水等）进行流感基因片段扩增、测序和进化分析，研究人员发现禽类中存在H7、H9、H5三个HA基因型的共流行以及N9和N2两个NA基因型的共流行；一株H9N2病毒在流感6个内部基因片段的进化分析中，总是紧密地聚类在新型H7N9形成的进化簇的外侧，表明（H9N2）是遗传上与新型H7N9最相关的H9N2流感病毒株。此外，研究还发现了2株疑似H9N9毒株。
研究人员表示，湖州北邻我国第三大淡水湖太湖，拥有两个天然的野鸟栖息地，具备H7N9起源的环境条件，相关研究结果提示湖州是新型H7N9的起源地之一。
