黄瓜、番茄根结线虫为南方根结线虫Meloidogyne incogita Chitwood，主要靠土壤、灌水及种苗传播，为害须根或侧根，形成根结状肿瘤。地上部重病株矮小瘦弱，结实少，严重时提早枯死。综合防治措施是：
1、加强检疫。检疫是防止根结线虫随种苗远距传播的有效手段。
２、清洁棚室。将植株病残体清除室外集中烧毁。
３、与禾本科作物或韭菜、葱、蒜轮作2－3年。
４、水淹防治。重病棚，可以采取冬季上冻前灌透水，不扣棚，水淹一冬，来年春再扣棚生产。
５、与韭菜、葱、蒜等作物间套作对根结线虫的发生有一定的抑制作用。
６、药剂防治。用药剂处理土壤费用较高，可在定植前，开沟或按安穴2浇灌1200－1500倍液的1．8％的爱福丁乳油或1．8的齐螨素乳油，缓苗后再追一次。对根结线虫的防治有较好效果。